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肺炎克雷伯菌单克隆抗体结合模式的可视化

托斯卡纳生命科学基金会(TLS)是一家位于锡耶纳(意大利)的非营利组织,支持生命科学的研究活动,从基础研究到工业应用。在他们的项目中,TLS的单克隆抗体发现(MAD)实验室专注于鉴定和生产单克隆抗体(mAb),作为针对细菌和病毒的新型疗法。与标准药物相比,mAb具有多种优势:例如,它们的特异性、有限的耐药性发展风险以及与抗生素协同作用的能力。此外,单克隆抗体有助于确定疫苗靶点并加速疫苗开发,从而成为抗击传染病的绝佳工具。

mAbs研究领域的一个相关方面是验证抗体与细菌表面的结合效率。在这里,我们显示了在TLS结合处分离的488-荧光团偶联mAb与表达mCherry的肺炎克雷伯菌的数据。通过SIMTRUM SpinDisk Advance共聚焦转盘系统以及SIM Basic Super-Resolution Addon,Celesta激光源(Lumencor)和sCMOS Prime BSI相机(光度学,6.5μm像素尺寸)获得收购。我们使用100倍油物镜(尼康,1.45 NA),并沿细菌体积(0.1 μm Z步长)进行Z-stack采集。

图1中,我们显示了使用SIMTRUM SpinDisk Advance共聚焦转盘采集的细菌细胞Z堆栈的最大强度投影(MIP)。为了更准确地鉴定细菌表面的mAb结合模式,我们使用SpinDisk Advance旋转盘的SIM基本超分辨率模块分析了样品,并将细菌可视化为3D体积。SIM Basic超分辨率模块可轻松集成到现有显微镜系统中,使用常规样品制备方案为复杂的生物标本提供结构化定位成像。在图2中,我们通过显示3D体积视图并突出显示仅在超分辨率图像中可见的细胞细节,特别是关于mAb染色(绿色),显示了共聚焦转盘和超分辨率采集之间的比较。

为了展示SIMTRUM SIM Basic如何与传统显微镜相比带来显着的收益,我们报告了从宽场到共聚焦转盘再到超分辨率采集的不同显微镜方法的全球比较(图3-4)。值得注意的是,与宽场、原始和去卷积的转盘数据相比,单克隆抗体3D组织、聚集体的交替甚至小而详细的突起都是可检测的,并且在超分辨率图像中肯定更清晰。总体而言,抗体和细菌之间结合质量和效率的筛选是适用于转盘显微镜的优秀生物学实例。在选择了有希望的抗体后,在相同的设置配置中轻松切换到超分辨率显微镜的可能性有助于研究人员深化数据并做出进一步的生物学考虑。SIMTRUM SpinDisk Advance转盘配置与SIM Basic模块是满足各种科学需求的完美解决方案,这些需求需要在实验方案的特定步骤中提高分辨率,而无需移动到不同的显微镜。


图 1:使用 SIMTRUM SpinDisk Advance 转盘采集的细菌细胞的 MIP 图像。 488-荧光团偶联的mAb以绿色显示,细胞质mCherry以红色显示。

图 2:感兴趣区域的 3D 体积视图,显示使用 SIMTRUM SpinDisk Advance 转盘 (SD) 和 SIM 基本超分辨率 (SR) 系统采集的细菌细胞。 488-荧光团偶联的mAb以绿色显示,细胞质mCherry以红色显示。箭头表示仅在SR图像中可见的结构细节示例。SR图像从65张原始图像开始处理,这些图像通过多点结构照明通过联合理查森-露西(jRL)算法的修改版本获得。


图 3单个 Z 计划显示了以不同模式(宽场、WF、转盘、SD;NIS Elements 软件提供的 3D Richardson-Lucy 算法(20 ite)进行去卷积 SD)采集的 mAb 染色(绿色);SIM Basic Super-Resolution,SR),带有 SIMTRUM SpinDisk Advance 系统。箭头表示只有通过提高图像分辨率才能看到的结构细节


图 4SIM 基本超分辨率 (SR) 图像的 3D 体积视图和视频


应用纪要是与Emanuele Roscioli博士、Anna Kabanova博士和Claudia Sala博士合作编写的。托斯卡纳生命科学基金会,锡耶纳(意大利)。